德國國內的政局變化很快就傳遞到了中國，此前一直把持著談判權力的德軍統帥瓦德西，不得不把談判權交給了外交官，德國駐華公使穆默終於擺脫了軍方的干涉，開始按照德國經濟界和實業界的呼聲，重新調整了談判方式。
八月中旬的一次和李鴻章的單獨會談中，穆默拋出了德國方面的談判新立場，「…我國民眾對於當前德中之間的關係感到遺憾，但是我國也還是有一部分試圖維持德國和中國之間的良好關係，使之不被克林德公使死亡一事所破壞。」
李鴻章對於穆默公使提出的新立場表示了歡迎，也對克林德公使死亡一事表示再一次的歉意，並詢問公使，自己要如何挽回德國對於清國的不利觀感。
穆默於是說道：「根據貴國在此次排外事件中的所作所為，我國政府認為14億金馬克的賠償並不是一個讓貴國政府難以接受的數字。」
看到李鴻章想要說點什麼，穆默於是又說道：「當然，我們也考慮到貴國東南各省在此次拳亂事件中並沒有參與，始終保持的對外國人友好的態度，因此我國政府認為，關於賠款問題還是可以進行協商，比如削減25%或20%的數額，這並不是不可能之事。」
李鴻章聽了這話頓時鬆了口氣，連連感謝道：「貴使若是能夠支持我國在賠款問題上進行協商，那麼我國必然不會忘記貴國的寬宏大度…」
聽完了李鴻章的恭維，穆默並沒有做出多少感動，而是向著李鴻章說道：「但是，要讓我國在賠款問題上幫助貴國，那麼貴國至少也該表明一下對於德國的友誼。」
聽到德國公使近乎赤|裸裸的明示，李鴻章一下就想起了關於湖廣總督張之洞提出的幾項建議，他雖然覺得有些為難，關於設立中央銀行一事，不僅國內意見不統一，俄國、英國、法國也表現出了極大的興趣，這讓李鴻章對於設立中央銀行一事也是相當的為難，生怕這將會變成又一頂賣國帽子。
看著李鴻章的搪塞之語，穆默也終於感到了不耐煩，於是便向著李鴻章說道：「假如閣下沒有能力做出這樣的決定，那麼我建議，讓湖廣總督和兩江總督派出代表參加談判。又或者，閣下就儘快在拳亂協定上簽字，也免了大家的麻煩。」
這一次和德國公使的談話，讓李鴻章意識到德國人已經傾向於張之洞的意見，繼續在這個問題上進行推脫，不僅將會讓張之洞和劉坤一更加的敵視自己，也會使得德國人在談判中製造更多的障礙。
李鴻章此時的外交政策，是親近俄國以平衡各國的壓迫，主要是抵抗日本對於大陸的野心。在甲午戰爭之後，李鴻章就意識到，大清不僅打不過歐洲列強，甚至連身邊的日本都打不過了。佔據了朝鮮半島的日本，對於中國的威脅越來越大，所以他才希望引入俄國的力量來平衡日本的壓力。
只不過李鴻章沒有預料到，俄國人的胃口比日本更大，不僅藉助修建鐵路的機會把勢力侵入了滿洲地區，更是要藉助此次拳亂佔住滿洲不肯走了。這個時候的李鴻章已經完全的失去了外交方向，他現在不過就是在維持局面，等待著列強自己爭出個高低，然後負責簽字而已。
如果不是東南督撫和士紳的反對，李鴻章對於此次同各國談判其實是沒有任何對策的，唯一的目標就是保住慈禧的地位，不能讓慈禧倒台，換成對淮系已經成為仇敵的光緒帝上台，那麼淮系的滅亡也就指日可待了。
但是現在東南督撫和士紳的一頓亂拳，雖然大大的壞了他的名聲，卻也在列強之間打出了一條縫隙。這個時候他也知道，如果能夠安撫住德國，那麼這場談判就還有一些挽回的餘地。
因為現在德國在聯軍中的地位有些超然，不僅得到了俄國、奧匈帝國的支持，日本和美國對德國也沒有交惡的意思，至於英國和法國對於德國的態度則是不對抗的立場。雖然英國依舊主導著聯軍談判的方向，但是德國的態度卻決定著談判是否能夠達成。
遠在西安的慈禧對於慶親王奕劻和李鴻章的請示，只是表達了對於聯軍什麼時候從北京撤兵的關注，並表示，只要聯軍能夠儘快從北京撤兵，那麼對於洋人的要求不妨先答應了再說，以待大清推行新政自強後，再圖後計。
對於慈禧的這種言論，李鴻章也知道不過是隨口說說，後計肯定是沒有的，但是讓洋人先退兵的急切心思是肯定有的。畢竟兩宮不迴鑾，那麼朝廷就不能稱之為朝廷。
慈禧需要回到北京，才能重新掌握這個國家，而為此付出一些代價，慈禧是不會介意的，畢竟這是愛新覺羅的家產，多一點少一點又有什麼關係？就算是他李鴻章的名聲，對於慈禧來說也是可以付出的代價而已。
李鴻章於是順水推舟，以政務處的名義，通知劉坤一、張之洞兩總督派出代表入京參加談判，以定東南賠償之問題。
8月底，張之洞派出了陶森甲、田邦璇等人作為代表，劉坤一則派出了張謇、湯壽潛、唐才常等人為代表。9月初，雙方在京城匯合，兩邊先進行了私下的交換意見，最終就辦理中央銀行、關稅的制定等問題提出了十九條意見，向慶親王奕劻和李鴻章進行了陳述。
奕劻自然是不肯承擔責任的，只是讓李鴻章負責同列強交涉，李鴻章便讓陶森甲、田邦璇去同德國公使交涉這十九條意見。李鴻章看過這十九條意見，認為這十九條意見雖然有利於中國，但是實際操作起來卻很困難，因此他想要看一看德國人的反應是什麼。
德國人對這十九條意見的反應可謂是積極的很，讓李鴻章都跌破了眼鏡。不過到了這個時候，他也無法再阻止東南督撫對於這場對外談判的干涉了，只能靜觀其變。
德國人對於十九條意見的支持，因為他們得到了想要得到的一切，中國的市場和對於中國金融的控制權力，條約中沒法體現出來的這些內容，中國人親自送到了德國人的手中。
在和中國人進行溝通完畢之後，德國公使穆默在公使團的會議中正式提出了削減賠款總額和對關稅進行重新整理的建議。
對於削減賠款總額這一條來說，英國和美國都是持贊成意見的，因為英、美、日三國商品佔有了中國進口商品價值的70%左右，過高的賠款將會損害英美商品在中國市場的擴張。至於日本，此時還沒有真正理解貿易和賠款之間複雜的經濟聯繫，因此試圖什麼好處都想拿到手。
至於對關稅進行重新整理一事，同樣遭到了英美日三國的反對，對於俄國、法國和其他國家來說，他們更加關注的是，關稅、鹽稅抵押權給誰的問題，因為中國人提出建立中央銀行之後，等於有了一個統一結算的金融機構，這就讓他們很難把本國的銀行推向中國。
德國人和中國人首先找上了英國人，就獲得英國的支持進行了三方會談。中國方面主要是以陶森甲、田邦璇、唐才常、張謇、湯壽潛五人為代表，最終以德國讓出了部分訂單，中國方面表示在關稅上依舊支持英國人擔任總稅務司，和制定不損害英國利益的關稅為條件，換取了英國人的鬆口。
主要是英國也不希望遠東的局勢再混亂下去了，俄國在遠東咄咄逼人的勢態，和東南民眾表現出的對於俄國不滿的姿態，讓英國不得不對湖廣和兩江的代表做出一定的讓步，以作為英國在遠東的後手。
英國公使薩道義對於滿清政府現在處於一種極為失望的狀態，英國人希望中國和俄國形成對立關係，但是慈禧和李鴻章對於俄國的親近，使得英國在東亞的平衡陷入了困境。而日本的龜縮，使得英國一時也難以確定日俄對峙的局面是否會出現，那麼英國就有必要在中國內部另外尋找一個能夠取代滿清政府的新力量，預備當滿清政府垮台之後，這個新力量能夠扛起同俄國對峙的責任來。
雖然湖廣和兩江的代表表現出了親德的姿態，但是對於英國人來說倒不是什麼大問題，因為德國距離中國實在太遠，沒有經過英國皇家海軍的許可，德國在中國的利益其實都是空中樓閣而已。德國對於中國人的扶持，到最後很容易就會成為英國的成果。
擺平了英國人之後，德國立刻就去找了俄國人進行交涉，德國和俄國之間的交涉就比較簡單了，德國對於俄國在滿洲和外蒙、新疆等地的領土要求並沒有什麼意見，所以德國也要求俄國不能阻止德國在關稅和賠款上的建議。俄國人選擇了接受。
至於法國人，此時正不欲同德國進行衝突，因為俄國正在遠東大肆擴張，這個時候挑起法德矛盾顯然不是什麼好主意。至於奧匈帝國，在遠東政策上一直都是跟隨德國的。於是真正對談判造成威脅的只有美國和日本了。
德國和英國開始大肆報道美國的排華法案，而這些新聞也開始在中文報紙上進行了刊登，中國人的排外情緒再一次被引發了，不過這一次的目標是美國人，這讓英國在仇恨度在中國下降了。